Actualités des plateformes

Deux Plateformes Technologiques de Genopole permettent à l’Université d’Evry-Val-d’Essonne de devenir Université pilote dans le programme de mise en place d’une infrastructure nationale mutualisée de gestion des données et métadonnées issues de la recherche.

Dans le cadre des activités de développement de ses plateformes, Genopole® a mis en œuvre une collaboration avec la plateforme nationale SIDR (Standard Based Infrastructure with Distributed Ressources) initiative conjointe de l’INSB et de l’INIST du CNRS. Cette collaboration a permis aux plateformes génopolitaines de Spectrométrie de Masse (Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l’Environnement LAMBE - UMR 8587 UEVE/CNRS/CEA) et de Biologie Structurale (Laboratoire Structure et Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques – SABNP UMR S 829 UEVE/Inserm) d’être retenues parmi les structures participant à la phase pilote du projet national SIDR.

La plateforme nationale SIDR (Standards-based Infrastructure with Distributed Resources) est une initiative conjointe de l’INSB (INstitut des Sciences Biologiques) et de l’INIST (INstitut de l’Information Scientifique et Technique) du CNRS. Elle a pour mission d’offrir un accès organisé à des ressources mutualisées (données, méta-données, calculs et traitements) générées par des approches multi-omiques, notamment, sur des espèces modèles (animales et végétales). La spécificité de SIDR porte sur la fourniture de ressources dont la qualité est spécifiée en accord avec les standards internationaux.

Dans sa phase de démarrage (phase pilote), les responsables de la plateforme SIDR ont sélectionné un panel de laboratoires et de plateformes technologiques permettant de diversifier les approches technologiques et d’inclure la notion de qualité orientée client inspirée de la norme ISO9001 version 2008 pour la mise en place des procédures de traitement des données et méta-données.

Dans le cadre des activités de développement de ses plateformes, Genopole a mis en œuvre une collaboration avec la plateforme SIDR, qui a permis à deux de ses plateformes (Spectrométrie de Masse, Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l’Environnement, LAMBE UMR8587 – UEVE/CNRS/CEA, et Biologie Structurale, Laboratoire Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques, SABNP UMR S 829 – UEVE/Inserm) d’être retenues parmi les structures participant à la phase pilote du projet national SIDR. L’objet de cette collaboration est de développer des protocoles de transfert, de standardisation et de stockage des métadonnées produites à destination des partenaires et clients externes des plateformes sélectionnées. Cette démarche permet d’apporter aux plateformes de Genopole un support important en bio-informatique et une amélioration dans l’organisation en ligne avec les exigences de la norme ISO 9001 version 2008.

La mise en place de cette collaboration a permis d’obtenir le financement par le GIS IBiSA, pour une durée de 12 mois, d’un poste d’Ingénieur de recherche dont la mission est d’assister les plateformes partenaires du projet SIDR à développer les nouveaux outils informatiques.

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Plateforme de Spectrométrie de Masse
Plateforme de Biologie Structurale
Le projet SIDR

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