La plate-forme abSYNTH (atelier de biologie de synthèse) est hébergée au plus près de l’UMR Génomique métabolique (CEA / CNRS / UEVE), en particulier de l’équipe iSSB. Elle a pour objectif de proposer de façon modulaire l’ensemble des tâches d’un projet de biologie de synthèse, de la conception jusqu’à sa réalisation.

La singularité de la plate-forme repose sur l’intégration en un lieu unique de l’ensemble des outils nécessaires au développement d’un projet de biologie de synthèse. L’innovation constante qui l’irrigue est fournie par les équipes de recherche de l’iSSB et ses partenaires extérieurs. Aujourd’hui, abSYNTH supporte une grande partie de l’activité scientifique des équipes de recherche de l’équipe iSSB, ainsi qu’une partie des activités expérimentales de plusieurs start-ups en biologie de synthèse.

Un calculateur de 4 Tflops et 30 To

Plate-forme abSYNTH
Joan Hérisson, responsable technique de la plate-forme, présente le calculateur

En 2018, la plate-forme a mis à jour la partie stockage de son calculateur pour l’amener à 30 To.

Financé conjointement par le Conseil départemental de l’Essonne, Genopole et la Région Ile-de-France, ce calculateur d’une puissance de 4 TFlops est disponible pour les activités de recherche de l’équipe iSSB et de ses partenaires. Il est également exploité par les outils logiciels accessibles sur le portail web de la plate-forme abSYNTH.

Toutes les étapes du développement d’un projet de biologie de synthèse

Trois modules constitutifs forment l’ossature de la plate-forme. Ces modules correspondent aux phases de conception, de construction et de caractérisation de nouveaux circuits génétiques. Ils s’appliquent à plusieurs échelles, depuis les bio-briques moléculaires jusqu’aux dispositifs et systèmes régulatoires et métaboliques.

- CONCEPTION : offre logicielle et outil de calcul intensif pour la conception de bio-briques moléculaires et de dispositifs et systèmes régulatoires et métaboliques ; aujourd’hui, une dizaine d’outils logiciels développés par l’iSSB sont accessibles sur absynth.issb.genopole.fr.

- CONSTRUCTION : chaîne d’assemblage automatisée de bio-briques en dispositifs et systèmes - clonage haut débit en phase liquide ; un robot, un service PCR, des centrifugeuses (dont une à haute performance), des agitateurs… sont actuellement en service sur la plate-forme.

- CARACTÉRISATION : procédé partiellement automatisé de tests phénotypiques des assemblages réalisés dans des microorganismes comme la bactérie ou la levure, en utilisant des approches de microfluidique ; la plate-forme s’appuie sur un plateau technique de microfluidique, un spectromètre de masse, un équipement de PCR quantitative, un système de documentation de gel, plusieurs lecteurs spectrofluorimétriques de plaques…

- Contact
- Plus d’information sur la plate-forme abSYNTH

#Biologie de synthèse #Plates-formes mutualisées