Menu menu
  • Flux RSS
  • Twitter
  • Facebook
  • Google Plus
  • LinkedIn
  • YouTube

Stage de M2 recherche

  • Partager
  • Imprimer

Société / Activité :

UMR-S 1204, INSERM/Université d'Evry-Val-d'Essonne/Université Paris-Saclay Laboratoire Structure et Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques

Lieu :

Evry CEDEX

Poste proposé

Intitulé du poste proposé
Recherche et enseignement

Poste basé à
Evry

Nature du contrat
Stage

Durée
6

Disponibilité
Janvier 2019

Rémunération envisagée
- de 20 000 euros

Détails de l’offre

Description entreprise
Le laboratoire SABNP (INSERM U1204) fait partie du Biocluster du Genopole d’Évry, est multidisciplinaire et accueille, en plus d’une plateforme de biologie structurale (Résonance Magnétique Nucléaire et Microscopie à Force Atomique) et des équipements de biologie moléculaire et cellulaire, une expertise et des équipements en bioinformatique structurale, avec un accès à un parc informatique en réseau comprenant des stations de travail et des clusters Linux, ainsi que les programmes et logiciels pertinents à la biologie computationnelle. L'étudiant(e) sera encadré(e) directement par le directeur de stage.

Le laboratoire s’intéresse aux ARN qui se lient aux protéines appelées RBP (RNA-binding proteins) avec un domaine CSD (Cold-Schock Domain) et qui sont impliqués dans la régulation de la traduction et de l’épissage de l’ARN et par conséquent dans plusieurs maladies neurodégénératives. Ces RBP sont essentiellement des protéines nucléaires qui peuvent s’associer à des granules de stress sous des conditions de stress.

The SABNP research laboratory (INSERM unit 1204/UEVE), a recently created research unit is part of Evry’s Genopole Biocluster -Genopole is France’s first high-level research cluster entirely devoted to biotherapies, and to genetic, genomic, and post-genome research. The lab is multidisciplinary and hosts, in addition to a structural biology platform (NMR and AFM) and to cellular and molecular biology facilities, structural bioinformatics skills with access to a local computer network including Linux clusters, a file server, workstations and software dedicated to biological modeling and simulation.

Description poste
Appliquer des méthodes de la bioinformatique structurale (modélisation et simulation moléculaires) afin de générer des modèles fiables tri-dimensionnels des complexes moléculaires entre les RBP d’intérêt dans le laboratoire (YB-1, Lin28a, Lin28b, etc.) et l’ARN, donnant lieu à la prédiction et à l’analyse de propriétés physico-chimiques et biologiques qui sont difficiles d’obtenir par des méthodes expérimentales. Ceci devra contribuer à la compréhension des mécanismes biomoléculaires d’action et devra avoir des implications importantes pour la conception et la découverte de nouvelles drogues.

Les données structurales expérimentales (RMN et MFA) provenant de ce laboratoire seront complémentaires à la modélisation de ces complexes RBP-ARN.

Apply and develop structural bioinformatics methodologies to generate accurate 3D models of the CSP-RNA molecular complexes of interest to the lab (YB-1, Lin28a, Lin28b, etc, …), leading to the prediction and analysis of physicochemical and biological properties that are difficult to access by experimental means, accelerating thus the understanding of the biological mechanisms of action and having important implications for the design and discovery of new drugs.

Experimental structural data coming from this laboratory (Atomic Force Microscopy and Nuclear Magnetic Resonance) will be complementary to the modeling of the CSP-RNA complexes.

Description profil
Bioinformatique linéaire (Analyse, comparaison et alignement multiple de séquences, recherche de motifs, etc.)

Bioinformatique structurale de base (Modélisation et simulation moléculaires)

SE Linux

Linear Bioinformatics (analysis, comparison and multiple alignment of sequences, motif search, etc.)
Structural bioinformatics (Molecular modeling and simulation)

Niveau d’études
Bac+4

Contact

Personne à contacter
Charbel MAROUN, PhD, HDR

Email
charbel.maroun@inserm.fr

Téléphone
0169477664

Adresse
rue du Père Jarlan

Code postal
91025

Ville
Evry CEDEX