Campus

Premier biocluster français, Genopole est un incubateur de projets d’excellence dédié aux biotechnologies. Situé à Evry-Courcouronnes, il offre un environnement unique aux chercheurs et aux entrepreneurs qui souhaitent innover et faire avancer la recherche.

Découvrir >

Offres

Que vous soyez chercheur, post-doctorant ou une jeune startup, Genopole vous accompagne à toutes les étapes de votre projet pour vous offrir les meilleures conditions possibles de développement business.

Découvrir >

Genopolitains

Chaque jour à Genopole chercheurs, entrepreneurs et étudiants se croisent, cohabitent et collaborent, pour une véritable émulation au service de l’innovation.

Découvrir >

Temps forts

Donner de l’envergure à la recherche et au travail de notre communauté fait aussi partie de nos missions à Genopole. Retrouvez les dernières avancées scientifiques, les succès des acteurs de la biotechnologie et les événements qui animent notre biocluster.

Découvrir >

Innover à nos côtés

Découvrir >

Identifier les acides aminés via un nanopore


Une équipe du Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l’Environnement (Lambe – Université d’Evry/Université de Cergy Pontoise/CNRS) est parvenue à identifier 13 des 20 acides aminés qui constituent les protéines en les passant dans un nanopore naturel d’aérolysine.
Membrane celullaire Membrane celullaire

L’aérolysine est une toxine naturelle de la bactérie Pseudomonas Aeruginosa qui agit en formant des pores de taille nanométrique dans les membranes des cellules qu’elle infecte. Ce nanopore naturel peut être utilisé comme un capteur ultra-sensible, sélectif et spécifique pour de nombreuses applications en biotechnologie (Cressiot et al., 2019, ACS Sensors). L’équipe du Lambe a exploité les propriétés du nanopore d’aérolysine et montré qu’il est possible, en conditions expérimentales contrôlées, d’identifier 13 des 20 acides aminés naturels en les faisant traverser le nanopore.

Un signal électrique spécifique lors du passage dans le nanopore

Chaque acide aminé est attaché à un peptide chargé positivement. Sous l’action d’un champ électrique, l’acide aminé ainsi lié entre dans le nanopore et y reste temporairement confiné. Il bloque ainsi le courant électrique, générant une signature électrique spécifique. Le nanopore est suffisamment sensible pour détecter également des modifications post-traductionnelles, c’est-à-dire les modifications chimiques subies par les acides aminés après la synthèse des protéines. Ces modifications sont importantes car elles régulent l’activité cellulaire des protéines.

Pourquoi caractériser le protéome ?

Ce travail est une première étape vers le séquençage des protéines qui assurent le fonctionnement cellulaire.

Accéder au séquençage du « protéome » d’une cellule ou d’un fluide biologique constitue un enjeu majeur de santé publique. En effet, tout comme le génome désigne l’information génétique totale d’un organisme, son protéome représente l’ensemble des protéines exprimées par les gènes, ainsi que les modifications chimiques qu’elles subissent. Le protéome assure le fonctionnement de l’organisme.

Contrairement au génome, le protéome varie en fonction de l’activité des cellules. Quand les cellules dysfonctionnent, notamment lors d’une maladie, le protéome en porte les marques. Caractériser finement le protéome pourrait ainsi conduire au diagnostic précoce de maladies graves comme les cancers, à la prévention de leur récidive, voire aider aux traitements personnalisés.

La perspective de ce travail est l’identification des sept acides aminés restants grâce aux progrès de l’instrumentation et à l’ingénierie des nanopores. Cette étude pourrait ensuite ouvrir la voie au séquençage des protéines par nanopore d’aérolysine, à l’échelle de la molécule unique.

Ce travail publié dans Nature Biotechnology (2020) fait suite à une première étude publiée dans Nature Communications (2018) sur la détection et la détermination de la taille et séquence d’homopeptides à l’aide de ce nanopore. Il résulte d’une collaboration entre le LAMBE, l’Hôpital Lariboisière, la start-up DreamPore, l’université de l’Illinois et l’université de Freiburg.

  • Références

    H Ouldali Sarthak K, Ensslen T, Piguet F, Manivet P, Pelta J, Behrends JC, Aksimentiev A, Oukhaled A. Electrical recognition of the twenty proteinogenic amino acids using an aerolysin nanopore. Nat Biotechnol. 2020 Feb ;38(2):176-181.
    doi.org/10.1038/s41587-019-0345-2


    F. Piguet, H. Ouldali, M. Pastoriza-Gallego, P. Manivet, J. Pelta and A. Oukhaled (2018). Identication of single amino acid differences in uniformly charged homopolymeric peptides with aerolysin nanopore, Nat. Com. 9:966.


    B. Cressiot, Ouldali H, Pastoriza-Gallego M, Bacri L, Van der Goot FG, Pelta J. Aerolysin, a Powerful Protein Sensor for Fundamental Studies and Development of Upcoming Applications. ACS Sens. 2019 Mar 22 ;4(3):530-548.

Contact

Université d'Evry

Juan Pelta
juan.pelta@univ-evry.fr

CY Cergy Paris Université

Abdelghani Oukhaled
abdelghani.oukhaled@u-cergy.fr

Article posté le 20 février 2020

Partager
Temps forts

Les dernières actualités


traitement des plaies diabétiques issu de peau et d’écailles de poissons

Un dispositif naturel pour soigner les plaies profondes

Le CHSF et le Ceritd expérimentent un traitement innovant et naturel des plaies diabétiques issu de peau et d’écailles de poissons.

Découvrir
SYSFATE - MultiLayer - Molecular Tissue Digitalization Analyzer

Equipe Sysfate : Un outil de digitalisation des organes

L’équipe Sysfate (Genoscope) a combiné l’analyse d’image et la génomique pour créer l’outil MULTILAYER qui digitalise les organes et tissus biologiques.

Découvrir
Fibres musculaires

Des signes de myopathie détectés avant la formation des muscles

Une équipe d’I-Stem révèle une manifestation très précoce de la myopathie de Duchenne, avant même la formation du muscle dans l’embryon.

Découvrir
Prais-Saclay Spring 2021

Genopole, partenaire innovation de Paris Saclay Spring

Genopole invite à Paris Saclay Spring pour découvrir la 1ère communauté d’innovation française, les tendances de la tech, dont la santé-biotech et foodtech – secteurs clés de Genopole.

Découvrir
Représentation de neurones - cellules affectées par la CMT

Thérapie génique en bonne voie contre la CMT

Une thérapie génique contre la CMT démontre son efficacité chez l’animal dans une publication co-signée par une équipe de recherche créée grâce au soutien de Genopole.

Découvrir
LAST - le maquillage par Global Bioenergies

Global Bioenergies lance sa marque de maquillage

Interview de Marc Delcourt, PDG fondateur de Global Bioenergies qui lance sa marque de produits de maquillage biosourcés

Découvrir
NEB France fête ses 10 ans à Genopole

New England Biolabs France fête ses 10 ans !

La filiale française de New England Biolabs implantée à Genopole depuis 2011, fête ses 10 ans, et vous donne rendez-vous pour célébrer l’événement chaque mois tout au long de l’année 2021.

Découvrir
Welcome Session de Genopole

Welcome Session – Accueil de la 8e promo Shaker

Première Welcome Session de l’année 2021, ce 30 mars, pour accueillir de nouveaux porteurs d’innovations biotech, au sein du biocluster.

Découvrir
Show-me - formation par simulation - IBISC

Show-me : un concept novateur de formation en chirurgie

L’ANR a retenu le projet Show-me de formation chirurgicale par RV. Porté par Ibisc, il témoigne de l’essor des technologies numériques à Genopole.

Découvrir
PEPTherapy - Cellules cancéreuses avec leurs cibles en rouge - PEP-010

Oncologie – Pep-Therapy lève 2,75 M€ pour son entrée en phase clinique

Pep-Therapy, société labellisée Genopole, et l'Institut Curie, obtiennent le feu vert de l’ANSM pour démarrer le premier essai clinique de leur candidat médicament PEP-010 contre les tumeurs solides avancées.

Découvrir
Visualisation et quantification par la technologie MTBench des interactions protéines-protéines, observées à l'Opera Phenix+ dans une lignée cellulaire.

La haute résolution sur la plateforme de Biologie structurale

A Genopole et l’Université d’Evry, la R&D en biologie structurale franchit un cap avec l’arrivée de l’imageur haute résolution Opera Phenix+.

Découvrir
Séquençage Haut Débit

Livre – La révolution biotechnologique et la médecine de demain

Genopole signe le chapitre sur la thérapie génique du livre «La révolution biotechnologique et la médecine de demain » paru le 18 mars aux éditions Doin.

Découvrir
Actualité antibiorésistance

Diagnostiquer l’antibiorésistance avec une application mobile

Deux laboratoires de Genopole (LaMME, Génomique métabolique), MSF et l’AP-HP ont conçu une application mobile qui diagnostique l’antibiorésistance

Découvrir
Covid illustration CP

POSCOVD : Un projet de diagnostic massif de la Covid-19

Le projet POSCOVD de l’équipe génopolitaine SysFate développe le diagnostic massif de la Covid-19 par séquençage simultané de milliers d’échantillons.

Découvrir
MSCA COFUND 2020 - ApogeeBio Lauréat

COFUND-MSCA2020 : L’Europe retient le projet ApogeeBio

L’Europe retient le projet ApogeeBio, soumis par Genopole et ses partenaires dans l’objectif d’attirer les meilleurs jeunes chercheurs sur le campus évryen à travers le financement d’allocations de recherche, dans le cadre du programme COFUND-Marie-Sklodovska-Curie (MSCA-Cofund-2020)

Découvrir
Genhotel - fibroblastes, cancer & Polyarthrite

Cancer, Polyarthrite : rôle de la reprogrammation cellulaire?

Le laboratoire GenHotel (Université d’Evry, Genopole) révèle le rôle commun de la reprogrammation cellulaire dans la polyarthrite rhumatoïde et le cancer.

Découvrir
Voeux du campus evryéen Recherche & enseignement supérieur 2021

Les vœux du campus 2021

27 janvier 2021 La cérémonie des vœux du campus évryen s’est tenue depuis l’amphithéâtre de l’université d’Evry. Les dirigeants de Genopole, l’université d’Evry Paris Saclay, et des grandes écoles Télécom SudParis, Ensiie, IMT- BS, ont adressé leurs vœux en présence de représentants des collectivités et de l’Etat.

Découvrir
Plateforme de séquençage Genopole

Réseau national de surveillance du Covid ?

14 janvier – 12 scientifiques signent une tribune dans Le Figaro pointant l’urgence d’un réseau national de surveillance des variants du coronavirus par séquençage.

Découvrir
Généthon essai clinique myopathie de Duchenne

Feu vert à un essai clinique pour la myopathie de Duchenne

Le 30 novembre 2020, l’Agence Nationale de Sécurité du Médicament et des produits de santé (ANSM) a autorisé Généthon à démarrer en France un essai clinique pour la myopathie de Duchenne.

Découvrir
Shaker #8 - Appel à candidature

Lancement de l’appel à candidatures Shaker#8

Shaker est un dispositif unique en France, un tremplin à double détente pour l’accélération de projets biotech innovants : sur le plan scientifique + sur le plan entrepreneurial.

Découvrir
Voir tout >
Avec le soutien de