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Vers la sélection génomique des insectes d’élevage


La France est historiquement une terre d’élevage. Filières bovine, laitière, ovine, porcine, avicole sont représentées sur l’hexagone. Avec le projet de sélection génomique du scarabée Tenebrio molitor, lancé par la société génopolitaine Ÿnsect en associant le centre de séquençage Genoscope, la France devient pionnière dans la filière entomocole : l’élevage d’insectes.
Ynsect & Genoscope : Vers la sélection génomique des insectes d’élevage Ynsect & Genoscope : Vers la sélection génomique des insectes d’élevage

Ÿnfabre* est un programme unique au monde. Il est piloté par la société Ÿnsect, qui construit actuellement la plus grande ferme d’insectes à destination de l’alimentation, animale aujourd’hui et humaine demain. L’objectif est de sélectionner des lignées d’insectes reproducteurs pour la production à grande échelle de vers de farine, la forme larvaire du ténébrion meunier, source de protéines et autres nutriments (huiles, vitamines…).

Ce projet agroindustriel est issu des recherches sur la production et la transformation du ver de farine, menées par Ÿnsect dans son laboratoire. Installé à Genopole depuis 2013, il est devenu l’un des plus grands centres privés de recherche sur l’insecte au monde.

Ÿnfabre s’appuie sur la connaissance du génome** de l’insecte, acquise récemment après son assemblage par le centre national de séquençage Genoscope (CEA), situé à Genopole. Les méthodes de pointe mises en œuvre ont délivré des séquences d’ADN de grandes longueurs, proches de la taille des chromosomes.
Ÿnsect peut ainsi opérer une sélection raisonnée sur des traits biologiques des insectes et sur la cartographie de ce génome de grande qualité. Les performances recherchées portent sur la rapidité de croissance, la reproduction, le taux de conversion alimentaire (rapport entre l’alimentation et la production de nutriments) et la résistance aux maladies.

L’enjeu de ce programme ambitieux est la sécurité alimentaire, notamment la production de protéines alternatives face à une population mondiale et donc des besoins en forte croissance, tout en réduisant l’impact environnemental par un élevage à grande échelle économe en ressources. Ÿnsect vient d’ailleurs de recevoir le 4 juillet 2022 un avis favorable de l’Agence européenne de sécurité des aliments (EFSA) pour la consommation humaine d’un nouvel insecte, le scarabée Buffalo (Alphitobius diaperinus).

En conclusion


L’union dans ce projet des expertises scientifiques et technologiques des deux acteurs génopolitains participe à la connaissance de la génétique des insectes, notamment du ver de farine, et place la France en leader de la production et sélection d’insectes d’élevage.

Mise à jour 2023

Un an après le lancement du projet Ÿfabre, une avancée majeure a été franchie avec la création d’une puce de génotypage, nommée Axiom® YNS_Mol1, une première mondiale pour l’élevage d’insectes.
Élément clé de la stratégie d’Ÿnsect, cette puce inédite dédiée au ver de farine Tenebrio molitor permettra d’assurer une sélection raisonnée basée sur la diversité génomique de l’espèce. Mise à disposition de la communauté scientifique, elle représente également un formidable outil pour la recherche fondamentale et un levier très puissant pour développer durablement l’activité des fermes d’insectes.

 

En savoir plus

* Ÿnfabre

Ÿnfabre a obtenu début 2022 un financement de 4,34 millions d’Euros du programme d’investissements d’avenir, opéré par Bpifrance.

Porté par Ÿnsect, le programme associe l’expertise de Genoscope en séquençage et génomique, de Aprex Solutions en outils numérique d’analyse et intelligence artificielle et de Thermo Fisher Scientific en séquençage et génotypage haut débit.

** Lire la publication sur le séquençage du génome de Tenebrio molitor

Chromosome-scale assembly of the yellow mealworm genome – A high-quality reference genome for Tenebrio molitor breeding and sustainable production. Open Research Europe 2022.
doi.org/10.12688/openreseurope.13987.2

 

Article posté le 12 juillet 2022

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