Etude des Polymorphismes des Génomes Végétaux (EPGV)

#Génomique / Post-génomique

• Génomique végétale
• Séquençage
• Génotypage à haut débit.

Les grands enjeux de l’amélioration des espèces végétales sont l’analyse de la diversité et de l’évolution des gènes et des génomes, la mise en évidence des facteurs contrôlant des caractères d’intérêt agronomique et adaptatif (cartographie génétique de QTL, génétique d’association), la sélection assistée par marqueurs et la sélection génomique.
Des besoins en séquençage et en génotypage très importants découlent de ces projets scientifiques.

L’unité INRA US1279 (Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux, EPGV) est intégrée depuis 2001 sur le site du CEA/Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) à Evry (91) pour :

•  Développer des protocoles adaptés aux spécificités des espèces végétales (taille des génomes, autogamie, allogamie, large variabilité génétique, polyploïdie…) en fonction des évolutions technologiques disponibles sur les plates-formes du CNRGH.
• Mettre au plus tôt à la disposition des différentes équipes scientifiques (Inra, Cirad…) les derniers outils et les capacités de séquençage et de génotypage à haut débit, afin de répondre aux besoins de leurs programmes scientifiques.
• Etablir en collaboration avec les bio-informaticiens les processus et les outils pour l’analyse et la gestion des données de polymorphisme.
• Participer au réseau des différentes plateformes de génomique et plus particulièrement de l’infrastructure nationale « France Génomique » dont l’unité EPGV est partenaire.

• COLLABORATION / CHAIRE

  L’unité EPGV est partenaire de nombreux programmes scientifiques nationaux et européens tels que des projets Investissements d’Avenir (PIA : BreedWheat, Amaizing, Sunrise) auxquels participent les principales entreprises semencières françaises, des projets ANR (H2OAK, CROC), des projets CASDAR (GenoParfum, FlorHiGe) en partenariat avec des sélectionneurs et instituts techniques.